Im hohen Mittelalter kam dann vor allem in Deutschland nach der Basilika ein anderer Bautyp in Mode: die Hallenkirche. Die Basilika hatte den Vorteil, dass das Mittelschiff durch die Fenster im Obergaden belichtet wurde. Auch war es aus statischen Gründen einfacher, die Seitenschiffe mehr oder weniger an das Mittelschiff „anzulehnen“. Das hohe und das ausgehende Mittelalter bevorzugte jedoch weite Räume. Dazu wurden die Seitenschiffe in ihrer Höhe dem Mittelschiff angeglichen. Der Obergaden und die Fenster darin verschwanden, zwar dafür konnte der ganze Raum durch große und im Laufe des Mittelalters größer werdende Fenster in den Seitenschiffe ausgeleuchtet werden.

Halle und Basilika gemein blieb, dass das Mittelschiff von den Seitenschiffen durch Säulen oder Pfeiler abgetrennt wurde.